cmd condition prevalence (.xlsx)

Download original .xlsx file from GitHub

info

	ResourceFile_cmd_condition_prevalence
0	Created by Britta Jewell on 25 March 2021
1
2	This file reads in parameters for the prevalence of each condition annually in the NCDs module in the TLO model. Each tab represents one condition modelled.

diabetes

	parameter_name	value	lower	upper	gbd_value	gbd_lower	gbd_upper	steps_value	steps_lower	steps_upper	Unnamed: 10	“value” source:	Price et al., 2018
0	m_0-4				0	0	0					“gbd_value” source:	GBD 2019
1	m_5-9				0	0	0					“steps_value” source:	STEPS Survey 2017
2	m_10-14				0	0	0
3	m_15-19				0.0044772	0.00642664	0.0027325
4	m_20-24	0.00168696	0.00058587	0.00851522	0.00984923	0.0125447	0.00727383	0.012	0	0.027
5	m_25-29	0.00168696	0.00058587	0.00851522	0.0162136	0.020664	0.0126633	0.012	0	0.027
6	m_30-34	0.01009132	0.00620218	0.02360654	0.0227069	0.0283987	0.0179371	0.008	0	0.017
7	m_35-39	0.01009132	0.00620218	0.02360654	0.0295803	0.0363708	0.0236241	0.008	0	0.017
8	m_40-44	0.0203044	0.015667419999999998	0.03636528	0.0386827	0.0465427	0.0317447	0.008	0	0.017
9	m_45-49	0.0203044	0.015667419999999998	0.03636528	0.0567465	0.0672648	0.0474089	0.009	0.001	0.017
10	m_50-54	0.0537392	0.033587000000000006	0.0747501	0.0835686	0.102379	0.0685028	0.009	0.001	0.017
11	m_55-59	0.0537392	0.033587000000000006	0.0747501	0.114105	0.135212	0.0965955	0.009	0.001	0.017
12	m_60-64	0.06714355999999999	0.03781962	0.10181098	0.148086	0.176163	0.123901	0.076	0.01	0.142
13	m_65-69	0.06714355999999999	0.03781962	0.10181098	0.190233	0.220267	0.163592	0.076	0.01	0.142
14	m_70-74	0.06690868000000001	0.04306952	0.11017173999999999	0.234498	0.266639	0.203621
15	m_75-79	0.06690868000000001	0.04306952	0.11017173999999999	0.260101	0.296488	0.224949
16	m_80-84	0.06690868000000001	0.04306952	0.11017173999999999	0.26367	0.299766	0.233063
17	m_85-89	0.06690868000000001	0.04306952	0.11017173999999999	0.245144	0.278171	0.216108
18	m_90-94	0.06690868000000001	0.04306952	0.11017173999999999	0.204814	0.237187	0.176556
19	m_95-99	0.06690868000000001	0.04306952	0.11017173999999999	0.143972	0.176831	0.118581
20	m_100+	0.06690868000000001	0.04306952	0.11017173999999999	0.143972	0.176831	0.118581
21	f_0-4				0	0	0
22	f_5-9				0	0	0
23	f_10-14				0	0	0
24	f_15-19				0.00337975	0.00504005	0.00195059
25	f_20-24	0.002	0.000923262	0.00948478	0.0069043	0.0092643	0.00488809	0.011	0.001	0.02
26	f_25-29	0.002	0.000923262	0.00948478	0.0114182	0.0149955	0.00856207	0.011	0.001	0.02
27	f_30-34	0.0058587	0.002	0.014576100000000002	0.0167289	0.0215564	0.0130087	0.021	0.01	0.031
28	f_35-39	0.0058587	0.002	0.014576100000000002	0.0237578	0.0292423	0.0193352	0.021	0.01	0.031
29	f_40-44	0.029445699999999998	0.026697859999999997	0.0403044	0.0328711	0.0396807	0.026764	0.021	0.01	0.031
30	f_45-49	0.029445699999999998	0.026697859999999997	0.0403044	0.0447636	0.0531027	0.0373941	0.01	0.002	0.019
31	f_50-54	0.05208267999999999	0.03581962	0.07717399999999999	0.060405	0.0716745	0.0501648	0.01	0.002	0.019
32	f_55-59	0.05208267999999999	0.03581962	0.07717399999999999	0.0830802	0.0969157	0.0702595	0.01	0.002	0.019
33	f_60-64	0.065677496	0.0413153	0.0966197	0.110807	0.12858	0.0938558	0.017	0.003	0.03
34	f_65-69	0.065677496	0.0413153	0.0966197	0.135501	0.154337	0.11798	0.017	0.003	0.03
35	f_70-74	0.07266742000000001	0.045706500000000004	0.1244457	0.154884	0.175589	0.135464
36	f_75-79	0.07266742000000001	0.045706500000000004	0.1244457	0.167481	0.190237	0.146451
37	f_80-84	0.07266742000000001	0.045706500000000004	0.1244457	0.171539	0.194006	0.152678
38	f_85-89	0.07266742000000001	0.045706500000000004	0.1244457	0.161698	0.184192	0.143452
39	f_90-94	0.07266742000000001	0.045706500000000004	0.1244457	0.13627	0.156406	0.118881
40	f_95-99	0.07266742000000001	0.045706500000000004	0.1244457	0.0946378	0.11327	0.0787506
41	f_100+	0.07266742000000001	0.045706500000000004	0.1244457	0.0946378	0.11327	0.0787506

hypertension

	parameter_name	value	lower	upper	steps_value	steps_lower	steps_upper	Unnamed: 7	“value” source:	Price et al., 2018
0	m_0-4								“steps_value” source:	STEPS Survey 2017
1	m_5-9
2	m_10-14
3	m_15-19
4	m_20-24	0.0468696	0.044808719999999996	0.055152200000000005	0.15	0.074	0.227
5	m_25-29	0.0468696	0.044808719999999996	0.055152200000000005	0.15	0.074	0.227
6	m_30-34	0.10177828	0.09515219999999999	0.118587	0.124	0.089	0.159
7	m_35-39	0.10177828	0.09515219999999999	0.118587	0.124	0.089	0.159
8	m_40-44	0.1288914	0.1230327	0.1706088	0.124	0.089	0.159
9	m_45-49	0.1288914	0.1230327	0.1706088	0.276	0.183	0.37
10	m_50-54	0.23434800000000003	0.21677190000000002	0.2895002	0.276	0.183	0.37
11	m_55-59	0.23434800000000003	0.21677190000000002	0.2895002	0.276	0.183	0.37
12	m_60-64	0.4009132	0.36091320000000005	0.474348	0.279	0.17	0.388
13	m_65-69	0.4009132	0.36091320000000005	0.474348	0.279	0.17	0.388
14	m_70-74	0.5009132	0.455761	0.5795002
15	m_75-79	0.5009132	0.455761	0.5795002
16	m_80-84	0.5009132	0.455761	0.5795002
17	m_85-89	0.5009132	0.455761	0.5795002
18	m_90-94	0.5009132	0.455761	0.5795002
19	m_95-99	0.5009132	0.455761	0.5795002
20	m_100+	0.5009132	0.455761	0.5795002
21	f_0-4
22	f_5-9
23	f_10-14
24	f_15-19
25	f_20-24	0.0134348	0.0125761	0.0242935	0.081	0.058	0.105
26	f_25-29	0.0134348	0.0125761	0.0242935	0.081	0.058	0.105
27	f_30-34	0.05202179999999999	0.0437392	0.055456599999999995	0.138	0.101	0.174
28	f_35-39	0.05202179999999999	0.0437392	0.055456599999999995	0.138	0.101	0.174
29	f_40-44	0.1374784	0.12582188	0.17091320000000002	0.138	0.101	0.174
30	f_45-49	0.1374784	0.12582188	0.17091320000000002	0.386	0.313	0.458
31	f_50-54	0.3526306	0.30202179999999995	0.38434799999999997	0.386	0.313	0.458
32	f_55-59	0.3526306	0.30202179999999995	0.38434799999999997	0.386	0.313	0.458
33	f_60-64	0.5074784	0.4640436	0.5609132	0.419	0.331	0.508
34	f_65-69	0.5074784	0.4640436	0.5609132	0.419	0.331	0.508
35	f_70-74	0.6774784	0.6281848999999999	0.7191958
36	f_75-79	0.6774784	0.6281848999999999	0.7191958
37	f_80-84	0.6774784	0.6281848999999999	0.7191958
38	f_85-89	0.6774784	0.6281848999999999	0.7191958
39	f_90-94	0.6774784	0.6281848999999999	0.7191958
40	f_95-99	0.6774784	0.6281848999999999	0.7191958
41	f_100+	0.6774784	0.6281848999999999	0.7191958

chronic_lower_back_pain

	parameter_name	value	lower	upper	Unnamed: 4	Unnamed: 5	Unnamed: 6
0	m_0-4	0	0	0		“value” source:	GBD 2019
1	m_5-9	0.0053	0.003	0.0084
2	m_10-14	0.0229	0.0153	0.0328
3	m_15-19	0.0341	0.0228	0.0489
4	m_20-24	0.0411	0.0281	0.058
5	m_25-29	0.0534	0.036	0.0731
6	m_30-34	0.0657	0.0462	0.0915
7	m_35-39	0.0819	0.0568	0.1127
8	m_40-44	0.0973	0.0669	0.1357
9	m_45-49	0.1095	0.0774	0.1519
10	m_50-54	0.1254	0.0853	0.1729
11	m_55-59	0.1405	0.1006	0.1895
12	m_60-64	0.1567	0.1126	0.2139
13	m_65-69	0.1757	0.1269	0.2409
14	m_70-74	0.1921	0.1377	0.259
15	m_75-79	0.2049	0.1476	0.2767
16	m_80-84	0.2056	0.158	0.2654
17	m_85-89	0.2056	0.158	0.2654
18	m_90-94	0.2056	0.158	0.2654
19	m_95-99	0.2056	0.158	0.2654
20	m_100+	0.2056	0.158	0.2654
21	f_0-4	0	0	0
22	f_5-9	0.0028	0.0013	0.0047
23	f_10-14	0.0125	0.008	0.0185
24	f_15-19	0.0213	0.014	0.0306
25	f_20-24	0.029	0.0191	0.0413
26	f_25-29	0.0377	0.0258	0.0518
27	f_30-34	0.0466	0.0328	0.0663
28	f_35-39	0.0602	0.0418	0.0829
29	f_40-44	0.0736	0.0493	0.1025
30	f_45-49	0.0876	0.0613	0.1221
31	f_50-54	0.1059	0.0737	0.147
32	f_55-59	0.125	0.089	0.1671
33	f_60-64	0.1461	0.1048	0.1981
34	f_65-69	0.1596	0.113	0.2167
35	f_70-74	0.1716	0.1213	0.2327
36	f_75-79	0.1859	0.1325	0.2582
37	f_80-84	0.1906	0.1467	0.2448
38	f_85-89	0.1906	0.1467	0.2448
39	f_90-94	0.1906	0.1467	0.2448
40	f_95-99	0.1906	0.1467	0.2448
41	f_100+	0.1906	0.1467	0.2448

chronic_kidney_disease

	parameter_name	value	lower	upper	gbd_value	gbd_lower	gbd_upper	Unnamed: 7	“value” source:	Nakanga et al. 2019
0	m_0-4				0.00255692	0.00319887	0.00200606		“gbd_value” source:	GBD 2019
1	m_5-9				0.00371278	0.00468917	0.00286889
2	m_10-14				0.0061868	0.00908298	0.00448046
3	m_15-19				0.0137078	0.0231063	0.00851325
4	m_20-24	0.0003	0.0003	0.0003	0.0281956	0.0488208	0.0159868
5	m_25-29	0.0003	0.0003	0.0003	0.0517956	0.0929709	0.0276113
6	m_30-34	0.0009	0.0009	0.0009	0.0834814	0.156243	0.0416993
7	m_35-39	0.0009	0.0009	0.0009	0.115192	0.217204	0.0570853
8	m_40-44	0.0033	0.0033	0.0033	0.135337	0.294774	0.0736934
9	m_45-49	0.0033	0.0033	0.0033	0.142722	0.255127	0.0773419
10	m_50-54	0.014	0.014	0.014	0.160194	0.269689	0.0878407
11	m_55-59	0.014	0.014	0.014	0.180531	0.299908	0.0963243
12	m_60-64	0.05	0.05	0.05	0.207884	0.332039	0.129019
13	m_65-69	0.05	0.05	0.05	0.262859	0.441759	0.156898
14	m_70-74	0.16	0.16	0.16	0.32175	0.51209	0.184222
15	m_75-79	0.16	0.16	0.16	0.365787	0.537517	0.248142
16	m_80-84	0.16	0.16	0.16	0.373024	0.50989	0.268238
17	m_85-89	0.16	0.16	0.16	0.344507	0.475384	0.248942
18	m_90-94	0.16	0.16	0.16	0.32002	0.44949	0.234287
19	m_95-99	0.16	0.16	0.16	0.312771	0.466587	0.225862
20	m_100+	0.16	0.16	0.16	0.312771	0.466587	0.225862
21	f_0-4				0.00273803	0.00328639	0.00219423
22	f_5-9				0.00360398	0.0043984	0.00287865
23	f_10-14				0.00547178	0.00835224	0.00387041
24	f_15-19				0.0121246	0.0206483	0.0070925
25	f_20-24	0.0003	0.0003	0.0003	0.0269679	0.048902	0.0143855
26	f_25-29	0.0003	0.0003	0.0003	0.0517027	0.0943903	0.0271254
27	f_30-34	0.0009	0.0009	0.0009	0.0834728	0.159149	0.0407822
28	f_35-39	0.0009	0.0009	0.0009	0.113658	0.21309	0.0554153
29	f_40-44	0.0033	0.0033	0.0033	0.13185	0.270861	0.0705371
30	f_45-49	0.0033	0.0033	0.0033	0.14036	0.249878	0.0769333
31	f_50-54	0.014	0.014	0.014	0.163039	0.268802	0.0870672
32	f_55-59	0.014	0.014	0.014	0.187413	0.301578	0.100809
33	f_60-64	0.05	0.05	0.05	0.217728	0.340314	0.133008
34	f_65-69	0.05	0.05	0.05	0.276124	0.451387	0.165055
35	f_70-74	0.16	0.16	0.16	0.336192	0.539004	0.190413
36	f_75-79	0.16	0.16	0.16	0.38355	0.573695	0.258577
37	f_80-84	0.16	0.16	0.16	0.408242	0.56643	0.286157
38	f_85-89	0.16	0.16	0.16	0.401826	0.550125	0.287672
39	f_90-94	0.16	0.16	0.16	0.393353	0.538132	0.29649
40	f_95-99	0.16	0.16	0.16	0.402685	0.579583	0.304552
41	f_100+	0.16	0.16	0.16	0.402685	0.579583	0.304552

chronic_ischemic_hd

	parameter_name	value	lower	upper	Unnamed: 4	“value” source:	GBD 2019
0	m_0-4	0	0	0
1	m_5-9	0	0	0
2	m_10-14	0	0	0
3	m_15-19	0.0001	0.0001	0.0002
4	m_20-24	0.0005	0.0004	0.0006
5	m_25-29	0.0015	0.0012	0.0018
6	m_30-34	0.0033	0.0027	0.0041
7	m_35-39	0.0065	0.0052	0.0081
8	m_40-44	0.0125	0.01	0.0155
9	m_45-49	0.0225	0.0185	0.028
10	m_50-54	0.0387	0.0314	0.0495
11	m_55-59	0.0635	0.0523	0.079
12	m_60-64	0.0976	0.0791	0.1213
13	m_65-69	0.1487	0.1219	0.1798
14	m_70-74	0.1999	0.1615	0.2435
15	m_75-79	0.2519	0.2074	0.3081
16	m_80-84	0.2745	0.2234	0.3405
17	m_85-89	0.2745	0.2234	0.3405
18	m_90-94	0.2745	0.2234	0.3405
19	m_95-99	0.2745	0.2234	0.3405
20	m_100+	0.2745	0.2234	0.3405
21	f_0-4	0	0	0
22	f_5-9	0	0	0
23	f_10-14	0	0	0
24	f_15-19	0.0001	0.0001	0.0001
25	f_20-24	0.0003	0.0002	0.0003
26	f_25-29	0.0008	0.0006	0.0009
27	f_30-34	0.0017	0.0014	0.002
28	f_35-39	0.0032	0.0027	0.0039
29	f_40-44	0.0061	0.005	0.0075
30	f_45-49	0.0113	0.0094	0.0138
31	f_50-54	0.0202	0.0168	0.0248
32	f_55-59	0.0343	0.0291	0.0412
33	f_60-64	0.0538	0.0444	0.0656
34	f_65-69	0.0828	0.0699	0.0986
35	f_70-74	0.1111	0.0933	0.1319
36	f_75-79	0.14	0.1184	0.1663
37	f_80-84	0.1558	0.1318	0.1847
38	f_85-89	0.1558	0.1318	0.1847
39	f_90-94	0.1558	0.1318	0.1847
40	f_95-99	0.1558	0.1318	0.1847
41	f_100+	0.1558	0.1318	0.1847